National Center for Gene Research ,CAS
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研究领域

  1998年, 基因中心作为中国大陆的参与单位,加入由政府和其它公共资金支持的国际水稻粳稻(Oryza sativa ssp japonica)基因组测序计划(International Rice Genome Sequencing Project,IRGSP),承担了第四号染色体的精确测序任务。该项目在国家人类基因组南方研究中心和中科院遗传与发育生物学研究所等单位的协作下顺利完成。
基因中心现有研究人员42名左右,其中博士研究生15名。研究部门由三部分组成:测序组、功能基因研究组、生物信息组和计算机系统组。目前,基因中心已向公共数据库递交了超过5千万碱基的水稻基因组DNA序列数据、水稻全长cDNA序列数据。今后基因中心将以水稻以及其他植物(能源植物)为研究方向,开展功能基因组研究。

  基因中心目前的研究领域主要集中在水稻的基因组测序、深度测序、比较基因组分析及功能基因组研究:

  水稻结构基因组学
  水稻籼粳稻精细物理图的构建
  水稻籼粳稻四号染色体的精确序列测定和序列分析
  籼粳稻比较基因组学研究
  水稻籼稻和野生稻BAC末端的测定

  水稻比较基因组和功能基因组学
  水稻4号染色体特异DNA芯片的研制及其基因表达谱的绘制
  水稻全长cDNA库的构建和序列分析
  水稻T-DNA插入突变体库插入位点的序列测定和数据库的构建
  水稻重要生物学功能基因的鉴定
  建立以第二代测序仪为基础的高通量功能基因组研究技术体系

  生物信息学研究
  基因组水平上基因注释相关软件开发及平台建立
  水稻籼稻cDNA数据库构建及其它相关数据库的构建
  水稻高通量测序数据分析
  (包括籼粳稻重组自交系的基因型鉴定、水稻核心种质的深度测序数据分析、水稻转录组数据分析等)及其它相关数据分析

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