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基因中心与水生所合作完成草鱼全基因组序列图谱

中科院水生生物研究所与本实验室合作,绘制出世界首个草鱼全基因组序列图谱。 该研究相关论文已由《自然·遗传学》杂志在线发表,研究者希望全球科学家据此进行进一步研究。
草鱼以草食性特征而得名,但它们如何从水草中汲取营养以支持其快速生长,一直是研究者未解开的问题。此外,草鱼产量约占全球淡水养殖鱼类总量的16%,研究草鱼基因将为养殖品种的遗传改良提供技术支撑。
研究采用鸟枪法测序策略,分别对一尾雌性和一尾雄性草鱼进行了全基因组测序。具体来说,研究者先将基因组随机打碎,再来测序,测序完成后再进行拼接。
在与现有的12种脊椎动物基因组比较研究后,研究者发现草鱼与斑马鱼经历了相似的基因组演化历程。最后,他们基于草鱼多个组织的转录组数据和斑马鱼同源基因信息,在雌性基因组中注释了27263个蛋白编码基因,找出其中17456个基因在草鱼染色体上的定位。
掌握草鱼的遗传信息,对我们选育出更优良的草鱼品种,具有基础性的科学意义,将大大加速育种科学进程。

论文链接:http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.3280.html

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